Brevi Ripetizioni Nel Genoma Hanno Mostrato La Relazione Tra Maiali E Primati - Visualizzazione Alternativa

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Anonim

Gli scienziati hanno scoperto nel genoma del maiale una famiglia di brevi ripetizioni uniche che hanno somiglianze evolutive con ripetizioni simili nei primati.

Scienziati della Jilin University (Changchun, Cina) e dell'Accademia delle scienze agricole (Heilongjiang, Cina) hanno preso parte al progetto in collaborazione con Firefly BioWorks Corporation (USA).

Dopo aver analizzato la struttura e l'origine del PRE-1 (elemento ripetitivo suino, letteralmente "elemento ripetitivo del maiale"), sono giunti alla conclusione che i parenti più stretti dei primati dell'ex supercontinente Laurasia potrebbero essere i maiali. Il preprint della ricerca è stato pubblicato sul server bioRxiv il 31 agosto 2015.

La CDP studiata (ripetizione corta dispersa) PRE-1 si trova nella regione intergenica, circa 686 ~ 985 coppie di basi prima dell'inizio del gene che codifica per la proteina legante il fattore di crescita dell'insulina (IGFBP7). La sequenza PRE-1 ripetuta di 299 coppie di basi è stata confrontata con 40 diverse ripetizioni Alu di primati e sono state trovate somiglianze significative sia nelle sequenze stesse che nel modello di distribuzione delle loro ripetizioni attraverso i cromosomi.

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La struttura secondaria prevista dell'RNA ripete PRE-1 ripiegata in un modello simile alle ripetizioni Alu. Infine, l'origine comune di PRE-1 e Alu dal cosiddetto RNA 7SL (RNA di riconoscimento del segnale) ha suggerito la loro somiglianza evolutiva e attribuito i maiali alla famiglia, che comprende principalmente i primati.

In precedenza, per costruire alberi filogenetici, gli scienziati si affidavano solo alle somiglianze e alle differenze dei geni, ignorando il fatto che durante l'evoluzione l'intero genoma ha subito cambiamenti, inclusi quelli dei suoi elementi che non codificano proteine o RNA, e il cui significato è ancora in gran parte poco chiaro agli scienziati.

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Questo studio, basato su un approccio integrato all'analisi degli elementi intergenici, fornisce, secondo gli autori, fatti "molto convincenti" dai quali si possono trarre conclusioni evolutive. In particolare, in base a questi risultati, il tempo stimato di divergenza delle specie varia da 65 a 80-100 milioni di anni fa.

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