I batteriofagi contenenti DNA senza coda non possono essere rilevati con metodi standard, ma ora gli scienziati ritengono che dominino gli oceani del mondo.
Ogni goccia d'acqua non troppo profonda dalla superficie del mare contiene circa 10 milioni di virus. Non sorprende che i biologi ne scoprano costantemente di nuovi, sebbene la scoperta di un gruppo completamente nuovo sia ancora molto rara. Sembra che le tecniche standard semplicemente non permettessero loro di essere notati, sebbene tali virus si siano rivelati estremamente numerosi - forse sono diffusi non solo nell'oceano e semplicemente sfuggono agli scienziati.
Martin Polz del Massachusetts Institute of Technology ei suoi colleghi hanno esaminato campioni d'acqua prelevati al largo della costa nordamericana dell'Oceano Atlantico. Hanno cercato virus contenenti DNA a doppio filamento: tali virus sono estremamente diffusi, compreso l'herpes e il batteriofago T4 (Caudovirales) familiare a tutti dalla scuola. Infettando colture di batteri marini Vibrionaceae, gli scienziati hanno scoperto 200 diversi virus a DNA, di cui 18 attribuiti al nuovo ordine Autolykiviridae. Ne scrivono in un articolo pubblicato sulla rivista Nature.
Il nome del gruppo si riferisce all'eroe della mitologia greca Autolico, un ladro astuto che è difficile da catturare come questi virus. "I virus più comuni sulla Terra sono virus che infettano batteri contenenti DNA a doppia elica", scrivono Poltz e i suoi coautori. “Tuttavia, i Caudovirales con virus dalla coda, che dominano i database e le raccolte di raccolti, non sono rappresentativi della loro presenza nell'ambiente. In effetti, i virus senza coda dominano i campioni d'acqua ".
Cellule batteriche infettate da Autolykiviridae / MIT Phages, Kauffman et al., 2018.
I batteriofagi "senza coda" Gli Autolykiviridae si distinguono per una piccola dimensione del genoma - solo circa 10 mila basi, 4-5 volte meno che nei parenti "dalla coda". Anche la loro capacità di infettare e uccidere le cellule batteriche era insolita. Se i fagi ordinari negli esperimenti, di regola, interessavano una specie specifica di vibrioni, questi ne infettavano in media quattro e portavano a una morte cellulare notevolmente più alta. "Si è scoperto che sono responsabili del 40 per cento delle morti batteriche, sebbene rappresentassero circa il 10 per cento del numero totale di virus nel campione", spiega uno degli autori del lavoro.
Batteri Vibrio di diverse specie si trovano lungo il perimetro del diagramma a cui sono associati i cerchi dei virus che li infettano: batteriofagi "dalla coda" blu, Autolykiviridae / MIT "senza coda" arancione, Kauffman et al., 2018.
Queste cifre indicano il grande ruolo che il nuovo gruppo degli Autolykiviridae gioca nella regolazione delle popolazioni batteriche e nella biosfera nel suo complesso. Gli scienziati sono fiduciosi che la loro tecnica aiuterà a trovare virus che in precedenza sono sfuggiti al rilevamento nel suolo e possibilmente nell'intestino umano. Sequenze genetiche simili si trovano infatti nei genomi dei batteri della microflora umana.
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Sergey Vasiliev
