I partecipanti del consorzio Genome 10K alla conferenza annuale, che si sta svolgendo ora a New York, hanno annunciato il lancio del progetto internazionale "Vertebrate Genomes", il suo compito è raccogliere i genomi di tutte le 66mila specie di vertebrati che vivono oggi sul pianeta. Gizmodo racconta di più sugli obiettivi e gli obiettivi del progetto.
Nel 2009, i biologi americani David Haussler, Oliver Ryder e Stephen O'Brien hanno fondato il progetto Genome 10K, il cui obiettivo era sequenziare 10.000 genomi di vertebrati. Inizialmente, hanno partecipato al progetto 55 scienziati provenienti da grandi zoo, centri di ricerca e musei. All'inizio, non era chiaro quanto tempo ci sarebbe voluto per assemblare genomi di qualità sufficiente. Ma con il costo e la semplificazione dei metodi di sequenziamento, è diventato chiaro che il progetto avrebbe completato i suoi compiti in pochi anni. Negli ultimi tre anni, i partecipanti al progetto hanno confrontato le principali tecnologie per il sequenziamento del DNA e l'analisi dei risultati ottenuti al fine di scegliere quella che creerà "genomi di platino".
Ieri, i membri di Genome 10K hanno annunciato il lancio di un nuovo progetto Vertebrate Genomes, che mira a raccogliere genomi maschili e femminili da 66.000 specie di vertebrati. Il progetto coinvolgerà 150 scienziati che rappresentano 50 organizzazioni di 12 paesi. Secondo uno dei fondatori del progetto, Oliver Ryder, di conseguenza, i biologi saranno in grado di comprendere le ragioni dell'estinzione delle specie, incluso se ci sono stati incroci strettamente correlati nella storia della specie, "colli di bottiglia", a seguito dei quali la diversità genetica della specie è diminuita o cancellazioni - mutazioni che possono "spegnere »Geni necessari per la sopravvivenza dell'organismo.
Insieme all'annuncio del nuovo progetto, gli scienziati hanno immediatamente presentato i primi risultati del suo lavoro: i genomi di 15 specie di vertebrati, tra cui il pappagallo gufo kakapo in via di estinzione, endemico della Nuova Zelanda, e l'ornitorinco australiano. Questi e tutti gli altri genomi che i ricercatori intendono raccogliere saranno pubblicati di pubblico dominio, nel database di Noah's Ark Genomic.
I partecipanti pianificano di sequenziare brevi sezioni di DNA genomico e raccogliere da esse sequenze sempre più lunghe fino all'intero cromosoma, quindi "incollarle" utilizzando algoritmi sviluppati appositamente per il progetto.
In precedenza, i ricercatori erano in grado di leggere il genoma di una persona su un sequencer tascabile delle dimensioni di uno smartphone. Il dispositivo ha stabilito il record per la lettura più lunga di una molecola di DNA, è stato in grado di sequenziare sequenze fino a 882 mila paia di basi.
Ekaterina Rusakova
